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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
22/12/2022 |
Data da última atualização: |
18/04/2024 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
DRUCKER, D. P.; SALIM, J. A; TREKELS, M.; GROOM, Q.; PARR, C.; SOARES, F. M.; AGOSTINI, K.; SARAIVA, A. M.; MOLLOY, L.; HODSON, S.; GREGORY, A. |
Afiliação: |
DEBORA PIGNATARI DRUCKER, CNPTIA; JOSÉ AUGUSTO SALIM, Universidade de São Paulo, Universidade Estadual de Campinas; MAARTEN TREKELS, MEISE BOTANIC GARDEN; QUENTIN GROOM, MEISE BOTANIC GARDEN; CYNTHIA PARR, U.S. DEPARTMENT OF AGRICULTURE; FILIPI MIRANDA SOARES, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO, UNIVERSITY OF TWENTE; KAYNA AGOSTINI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; ANTONIO MAURO SARAIVA, UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO; LAURA MOLLOY, CODATA; SIMON HODSON, CODATA; AROFAN GREGORY, CODATA. |
Título: |
Plant-pollinator interaction data: a case study of the WorldFAIR Project. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Biodiversity Information Science and Standards, v. 6, e94310, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.3897/biss.6.94310 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Edição de resumos de The Biodiversity Information Standards (TDWG) annual conference, 2022, Sofia, Bulgaria. |
Conteúdo: |
Biodiversity is a data-intensive science and relies on data from a large number of disciplines in order to build up a coherent picture of the extent and trajectory of life on earth (Bowker 2000). The ability to integrate such data from different disciplines, geographic regions and scales is crucial for making better decisions towards sustainable development. As the Biodiversity Information Standards (TDWG) community tackles standards development and adoption beyond its initial emphases on taxonomy and species distributions, expanding its impact and engaging a wider audience becomes increasingly important. |
Palavras-Chave: |
Biotic interaction; FAIR; Projeto WorldFAIR. |
Thesagro: |
Agricultura; Polinização. |
Thesaurus Nal: |
Agriculture; Pollination. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150244/1/AP-Plant-pollinator-Interaction-2022.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
21/12/2017 |
Data da última atualização: |
21/12/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S. |
Afiliação: |
SABRINA KLUSKA, FAPESP; RAFAEL LARA TONUSSI, UNESP; RAFAEL MEDEIROS DE OLIVEIRA SILVA, UNIVERSITY OF GEORGIA; BIANCA FERREIRA OLIVIERI, UNESP; FABIELI LOISE BRAGA FEITOSA, UNESP; ELISA PERIPOLLI, UNESP; MARCOS VINICÍUS ANTUNES LEMOS, UNESP; MARIANA PIATTO BERTON, UNESP; HERMENEGILDO LUCAS JUSTINO CHIAIA, UNESP; ANGELICA SIMONE CRAVO PEREIRA, USP; RAYSILDO BARBOSA LÔBO, ANCP; LUIZ ANTÔNIO BEZERRA, USP; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC; IGNÁCIO AGUILAR, INIA; FERNANDO DI CROCE, ZOETIS; JASON OSTERSTOCK, ZOETIS; FERNANDO BALDI, UNESP. |
Título: |
Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto, SP. Fenômica e outras ômicas na produção animal: anais... Sertãozinho: Sociedade de Melhoramento Animal/Instituto de Zootecnia, 2017. SBMA 2017. |
Páginas: |
3 p. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de 5%. Os resultados obtidos neste estudo indicam que, a densidade de marcadores utilizados foi capaz de detectar altos níveis de LD. Adicionalmente, conclui-se que marcadores distanciados até 50 Kb ainda detectam consideráveis níveis de LD. Abstract: Considering the importance of estimating linkage disequilibrium for genomic selection, the objective of this study was to estimate the linkage disequilibrium in a population of Nellore cattle participating in the ANCP breeding program. Information from 9,396 genotyped animals with a high density panel, totaling 735,044 SNP's before quality control were used. The estimation of linkage dissequilibrium (LD) was performed using the SNP1101 program. The mean LD values observed for the autosomal chromosomes ranged from 0.18 to 0.25. For markers distanced lower than 1 Kb the r² mean was 0.53, and for markers distanced between 90 and 100 Kb was 0.14. For MAF, the mean ranged from 0.23 to 0.25, a minimum MAF of 0.05 was considered. The results obtained in this study indicated that the density of markers used was able to detect high levels of LD. Additionally, for markers distanced up to 50 Kb, considerable levels of LD was detected. MenosResumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de 5%. Os resultados obtidos neste estudo indicam que, a densidade de marcadores utilizados foi capaz de detectar altos níveis de LD. Adicionalmente, conclui-se que marcadores distanciados até 50 Kb ainda detectam consideráveis níveis de LD. Abstract: Considering the importance of estimating linkage disequilibrium for genomic selection, the objective of this study was to estimate the linkage disequilibrium in a population of Nellore cattle participating in the ANCP breeding program. Information from 9,396 genotyped animals with a high density panel, totaling 735,044 SNP's before quality control were used. The estimation of linkage dissequilibrium (LD) was performed using the SNP1101 program. The mean LD values observed for the ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Densidade de Marcadores. |
Thesagro: |
Cromossoma; Marcador Genético; Seleção Genótipa. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/169674/1/Caracterizacao-do-desequilibrio-de-ligacao-em-uma-populacao-de-bovinos-da-raca-Nelore.pdf
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Marc: |
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Embrapa Cerrados (CPAC) |
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